Den brune rotte er den største mus i Danmark og tilhøre familien ægte mus. Den har et hoved med spids snude, relativt små, nøgne ører og store øjne. Oversiden af rotten er mørkebrun til gråbrun, på bugen er pelsen gråhvid. Den er en gnaver og har derfor store mejselformede, rodåbne fortænder, der kan gnave igennem alt, der er blødere end jern. Den måler fra snudespids til halerod 21-29 cm. Halen måler omkring 20 cm i længde, men er kortere end kroppen, og fremstår nøgen, men er dækket af små stive børster. Hannen er større end hunnen, vægten ligger som regel mellem 200 og 250 gram, men kan veje helt op til 500 gram.